Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrn1Q61809 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrn1Q61809 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms