Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin1Q61644 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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