Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ecm1Q61508 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ecm1Q61508 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ecm1Q61508 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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