Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift88Q61371 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift88Q61371 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift88Q61371 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift88Q61371 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift88Q61371 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift88Q61371 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms