Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms