Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms