Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Cep250Q60952 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cep250Q60952 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms