Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms