Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SkiQ60698 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms