Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Satb1Q60611 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Satb1Q60611 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Satb1Q60611 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms