Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf123Q5XPI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf123Q5XPI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms