Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd5Q5VCS6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms