Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim58Q5NCC9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms