Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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