Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg1lQ3V384 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg1lQ3V384 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg1lQ3V384 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms