Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdm5aQ3UXZ9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms