Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mbd3l2Q3UXB0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms