Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms