Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms