Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms