Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms