Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms