Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp19Q3UJD6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms