Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b2Q3UJB0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms