Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nkx6-3Q3UHX8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Nkx6-3Q3UHX8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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