Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm45902Q3UDN3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm45902Q3UDN3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms