Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms