Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf180Q3U827 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Rnf180Q3U827 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms