Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ssbp4Q3U4B1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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