Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Hbq1bQ3U0A6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Hbq1bQ3U0A6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms