Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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