Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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