Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
XylbQ3TNA1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms