Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam107bQ3TGF2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam107bQ3TGF2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms