Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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