Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms