Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39dQ0VF76 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms