Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms