Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms