Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Ttc21bQ0HA38 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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