Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NrepQ07475 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NrepQ07475 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms