Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfe2Q07279 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms