Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah2Q06986 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms