Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox8Q04886 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms