Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms