Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms