Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms