Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl7Q03366 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms