Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Htr1fQ02284 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms