Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms